Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSG101Q99816 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSG101Q99816 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSG101Q99816 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSG101Q99816 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSG101Q99816 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSG101Q99816 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TSG101Q99816 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TSG101Q99816 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSG101Q99816 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSG101Q99816 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSG101Q99816 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSG101Q99816 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSG101Q99816 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms