Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MTRQ99707 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MTRQ99707 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRQ99707 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MTRQ99707 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MTRQ99707 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MTRQ99707 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MTRQ99707 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MTRQ99707 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MTRQ99707 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms