Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ARXQ96QS3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARXQ96QS3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms