Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS1

YPEL4, Protein yippee-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL4Q96NS1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
YPEL4Q96NS1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
YPEL4Q96NS1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
YPEL4Q96NS1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
YPEL4Q96NS1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms