Protein–RNA interactions for Protein: Q96N28

PRELID3A, PRELI domain containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3AQ96N28 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRELID3AQ96N28 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRELID3AQ96N28 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms