Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CNBD2Q96M20 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CNBD2Q96M20 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms