Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC136Q96JN2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC136Q96JN2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC136Q96JN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms