Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFT43Q96FT9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFT43Q96FT9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms