Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDX11Q96FC9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
DDX11Q96FC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms