Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC51Q96ER9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC51Q96ER9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms