Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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RNF183Q96D59 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF183Q96D59 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF183Q96D59 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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