Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFT2D1Q8WV19 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SFT2D1Q8WV19 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms