Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUF8

FAM172A, Protein FAM172A, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM172AQ8WUF8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM172AQ8WUF8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM172AQ8WUF8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM172AQ8WUF8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms