Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms