Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM35BQ8NCS4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM35BQ8NCS4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms