Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KDM1BQ8NB78 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM1BQ8NB78 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms