Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATG16L2Q8NAA4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms