Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPA2Q8N8Q9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPA2Q8N8Q9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms