Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA2D3Q8IZS8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA2D3Q8IZS8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms