Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KSR1Q8IVT5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KSR1Q8IVT5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 678.9 ms