Protein–RNA interactions for Protein: Q86TS9

MRPL52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL52Q86TS9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL52Q86TS9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms