Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NANOGNBQ7Z5D8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NANOGNBQ7Z5D8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms