Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
UBE2R2Q712K3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UBE2R2Q712K3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms