Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAD11Q709F0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAD11Q709F0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAD11Q709F0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAD11Q709F0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAD11Q709F0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAD11Q709F0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACAD11Q709F0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACAD11Q709F0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACAD11Q709F0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms