Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RBM43Q6ZSC3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RBM43Q6ZSC3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBM43Q6ZSC3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms