Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms