Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATRAIDQ6UW56 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms