Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZBED9Q6R2W3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZBED9Q6R2W3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
ZBED9Q6R2W3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
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