Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 NCOA7-209ENST00000444128 2978 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 45.8
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PRPF8Q6P2Q9 TTC23-203ENST00000394132 3849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.224e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 TTC23-214ENST00000558663 2068 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.224e-12■■■■■ 45.5
PRPF8Q6P2Q9 TTC23-206ENST00000459771 3538 ntTSL 1 (best)7.25□□□□□ -1.254e-12■■■■■ 45.5
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