Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRAMD4Q6IC98 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRAMD4Q6IC98 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRAMD4Q6IC98 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms