Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LGALS9CQ6DKI2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LGALS9CQ6DKI2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms