Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC9A4Q6AI14 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A4Q6AI14 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms