Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GARNL3Q5VVW2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GARNL3Q5VVW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms