Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC38Q5R3I4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC38Q5R3I4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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