Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCNT1Q5JUK3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNT1Q5JUK3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms