Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERCC6LQ2NKX8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC6LQ2NKX8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC6LQ2NKX8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms