Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPRED3Q2MJR0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPRED3Q2MJR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms