Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MRPL23Q16540 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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