Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NTRK3Q16288 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NTRK3Q16288 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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