Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC6Q16204 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC6Q16204 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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