Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNHIT3Q15649 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNHIT3Q15649 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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