Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 GYPB-206ENST00000506516 473 ntTSL 1 (best)8.06□□□□□ -1.122e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-204ENST00000504951 632 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.322e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-212ENST00000511198 444 ntTSL 1 (best)6.71□□□□□ -1.342e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.372e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-205ENST00000505583 583 ntTSL 1 (best)6.48□□□□□ -1.372e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-215ENST00000513677 221 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.392e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-208ENST00000507009 388 ntTSL 1 (best)6.35□□□□□ -1.392e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.522e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-214ENST00000513557 277 ntTSL 1 (best)5.5□□□□□ -1.532e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-207ENST00000506679 606 ntTSL 1 (best)4.21□□□□□ -1.742e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 GYPB-211ENST00000510196 508 ntTSL 1 (best)3.16□□□□□ -1.92e-29■■■■■ 27.7
PCBP1Q15365 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.219e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 221.6■■□□□ 1.059e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.959e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 214.92□□□□□ -0.029e-66■■■■■ 27.6
PCBP1Q15365 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.061e-31■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 HDAC7-219ENST00000470668 4266 ntTSL 213.7□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.263e-7■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-7■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 PTPN23-206ENST00000602307 5119 ntTSL 212.17□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 PRRC2A-214ENST00000492691 1118 ntTSL 213.77□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 PRRC2A-213ENST00000487839 1071 ntTSL 510.77□□□□□ -0.693e-10■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 HDAC7-210ENST00000430670 914 ntTSL 518.94■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 27.5
PCBP1Q15365 NUCB1-212ENST00000492367 1515 ntTSL 220.79■□□□□ 0.921e-10■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.271e-10■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.021e-10■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 MINK1-207ENST00000572330 5299 ntTSL 515.74■□□□□ 0.113e-17■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.453e-17■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-10■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.962e-10■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.31e-11■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 PRKD2-203ENST00000593363 669 ntTSL 216.52■□□□□ 0.241e-11■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.021e-11■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.091e-11■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 PRKD2-211ENST00000598633 541 ntTSL 513.67□□□□□ -0.221e-11■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 RALY-209ENST00000489384 227 ntTSL 37.31□□□□□ -1.241e-13■■■■■ 27.4
PCBP1Q15365 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.049e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.039e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 RHBDD2-204ENST00000454791 1831 ntTSL 227.63■■■□□ 2.019e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.889e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.839e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.769e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.626e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.619e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CDC34-205ENST00000606065 1062 ntTSL 524.91■■□□□ 1.589e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.289e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-208ENST00000443147 2054 ntTSL 222.64■■□□□ 1.226e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 TRPM4-210ENST00000598691 594 ntTSL 522.29■■□□□ 1.169e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 322.08■■□□□ 1.136e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 SIGMAR1-202ENST00000353468 1582 ntTSL 1 (best)21.98■■□□□ 1.119e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 421.45■■□□□ 1.026e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.986e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.986e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CDC34-206ENST00000606400 899 ntTSL 220.87■□□□□ 0.939e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 320.8■□□□□ 0.926e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.916e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 NELFA-210ENST00000455762 1022 ntTSL 520.57■□□□□ 0.889e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.886e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CDC34-202ENST00000586283 1147 ntTSL 320.01■□□□□ 0.799e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.629e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 ELMSAN1-206ENST00000451078 2633 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.599e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.536e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 NELFA-207ENST00000431323 888 ntTSL 516.93■□□□□ 0.39e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.273e-7■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.276e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PIGQ-221ENST00000636657 2841 ntTSL 516.55■□□□□ 0.246e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 FAM83H-202ENST00000395103 3611 ntTSL 216.39■□□□□ 0.219e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 NELFA-206ENST00000421397 574 ntTSL 516.23■□□□□ 0.199e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-7■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.149e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.129e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 NELFA-208ENST00000443203 553 ntTSL 415.54■□□□□ 0.089e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CUL2-205ENST00000374754 4440 ntTSL 515.38■□□□□ 0.059e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PHACTR4-203ENST00000463428 1421 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.039e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.029e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-10■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 ELMSAN1-205ENST00000435371 3839 ntTSL 1 (best)14.32□□□□□ -0.129e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.129e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 NELFA-204ENST00000411649 561 ntTSL 413.08□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 TMEM219-207ENST00000570255 926 ntTSL 213.03□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PHACTR4-206ENST00000632421 3375 ntTSL 212.82□□□□□ -0.369e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 SYNGAP1-201ENST00000293748 4556 ntTSL 512.19□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CUL2-203ENST00000374749 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.479e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PHACTR4-204ENST00000493669 3078 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.579e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PHACTR4-202ENST00000373839 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.579e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CUL2-202ENST00000374748 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.579e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 ELMSAN1-204ENST00000423556 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.619e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 DHCR24-202ENST00000436604 863 ntTSL 311.15□□□□□ -0.622e-12■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 DHCR24-203ENST00000535035 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.722e-10■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.749e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.999e-9■■■■■ 27.3
PCBP1Q15365 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.449e-9■■■■■ 27.3
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