Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 LDHA-224ENST00000545467 570 ntTSL 29.02□□□□□ -0.973e-8■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 LDHA-217ENST00000539814 556 ntTSL 48.53□□□□□ -1.043e-8■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 LDHA-221ENST00000543445 576 ntTSL 36.64□□□□□ -1.353e-8■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.573e-8■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 EEF1A1-204ENST00000356303 635 ntTSL 29.72□□□□□ -0.854e-26■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 EEF1A1-206ENST00000488500 792 ntTSL 27.86□□□□□ -1.154e-26■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-204ENST00000594806 861 ntTSL 528.2■■■□□ 2.15e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.915e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.635e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.545e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-218ENST00000561012 585 ntTSL 324.01■■□□□ 1.435e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.355e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 220.48■□□□□ 0.875e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-206ENST00000485213 947 ntTSL 220.29■□□□□ 0.842e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.845e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.715e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 519.05■□□□□ 0.645e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 518.89■□□□□ 0.615e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.615e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.565e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-215ENST00000601150 915 ntTSL 318.45■□□□□ 0.545e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-204ENST00000466764 1375 ntTSL 318.41■□□□□ 0.542e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.475e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.465e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-221ENST00000564367 582 ntTSL 317.83■□□□□ 0.445e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-211ENST00000491240 951 ntTSL 1 (best)17.82■□□□□ 0.442e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.415e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-205ENST00000472897 501 ntTSL 517.18■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.325e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-207ENST00000488216 835 ntTSL 316.96■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-209ENST00000597423 733 ntTSL 316.6■□□□□ 0.255e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 NSUN2-208ENST00000513888 1290 ntTSL 216.49■□□□□ 0.235e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 FLOT2-209ENST00000584569 266 ntTSL 315.95■□□□□ 0.145e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-208ENST00000489344 724 ntTSL 214.96□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-220ENST00000561060 891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.145e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-212ENST00000597995 702 ntTSL 213.63□□□□□ -0.235e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RBM3-209ENST00000490127 567 ntTSL 512.34□□□□□ -0.432e-6■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-210ENST00000597618 609 ntTSL 211.03□□□□□ -0.645e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 TRIM28-208ENST00000597172 577 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-216ENST00000560470 558 ntTSL 410.15□□□□□ -0.785e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)9.06□□□□□ -0.965e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-210ENST00000558997 741 ntTSL 58.53□□□□□ -1.045e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.215e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.345e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.375e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-209ENST00000558724 621 ntTSL 56.22□□□□□ -1.415e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-214ENST00000560228 492 ntTSL 35.81□□□□□ -1.485e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-205ENST00000558272 583 ntTSL 35.8□□□□□ -1.485e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-206ENST00000558390 566 ntTSL 45.79□□□□□ -1.485e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.515e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-202ENST00000557793 532 ntTSL 25.64□□□□□ -1.515e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-215ENST00000560392 568 ntTSL 45.16□□□□□ -1.585e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-217ENST00000560976 560 ntTSL 45.05□□□□□ -1.65e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.675e-7■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RPS29-208ENST00000557519 333 ntTSL 310.68□□□□□ -0.78e-10■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RPS29-204ENST00000554075 826 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.928e-10■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 RPS29-205ENST00000556230 624 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.058e-10■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 AC005307.1-201ENST00000567877 1570 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.745e-8■■□□□ 14.3
NOLC1Q14978 BAG6-250ENST00000451898 993 ntTSL 320.53■□□□□ 0.886e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 BAG6-248ENST00000441054 654 ntTSL 319.35■□□□□ 0.696e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 518.48■□□□□ 0.556e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 BAG6-240ENST00000424480 1056 ntTSL 218.27■□□□□ 0.526e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 BAG6-244ENST00000435080 1710 ntTSL 515.9■□□□□ 0.146e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 BAG6-255ENST00000456622 859 ntTSL 513.2□□□□□ -0.36e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 BAG6-239ENST00000424176 747 ntTSL 312.98□□□□□ -0.336e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-208ENST00000470019 4016 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-201ENST00000230418 3958 ntTSL 1 (best)16.61■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-215ENST00000487673 5282 ntTSL 215.98■□□□□ 0.153e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PTK7-213ENST00000481273 3436 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.363e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.122e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.112e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.042e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 NAP1L1-210ENST00000547773 1967 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 NAP1L1-203ENST00000431879 2031 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.421e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 NAP1L1-223ENST00000552013 679 ntTSL 27.29□□□□□ -1.241e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 NAP1L1-225ENST00000552147 1009 ntTSL 56.13□□□□□ -1.431e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 515.51■□□□□ 0.073e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.633e-8■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.935e-10■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.675e-10■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.585e-10■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.35e-10■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 ST6GAL1-214ENST00000455441 596 ntTSL 422.4■■□□□ 1.183e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 ST6GAL1-205ENST00000427315 544 ntTSL 422.22■■□□□ 1.153e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.253e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 TXNDC5-205ENST00000475802 582 ntTSL 212.88□□□□□ -0.357e-27■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 TXNDC5-202ENST00000460138 2704 ntTSL 212.76□□□□□ -0.377e-27■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 RELN-205ENST00000473457 641 ntTSL 39.87□□□□□ -0.832e-14■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 RPL9-206ENST00000504470 689 ntTSL 214.08□□□□□ -0.162e-6■■□□□ 14.2
NOLC1Q14978 RPL9-209ENST00000511075 1028 ntTSL 27.33□□□□□ -1.242e-6■■□□□ 14.2
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 133.6 ms