Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
IRF3Q14653 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
IRF3Q14653 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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