Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SEMA3AQ14563 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA3AQ14563 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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