Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBM39Q14498 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RBM39Q14498 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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