Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL9A3Q14050 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL9A3Q14050 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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