Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TUBA3CQ13748 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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TUBA3CQ13748 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TUBA3CQ13748 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TUBA3CQ13748 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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