Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRJQ12913 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPRJQ12913 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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