Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIPPLY1Q0D2K3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms